О принятии к вычету НДС покупателем по счету-фактуре, выставленному продавцом на УСН

В письме от 05.10.2015 № 03-07-11/56700 Минфин России рассмотрел вопрос, может ли покупатель принять к вычету НДС, если счет-фактура выставлен "упрощенцем".
Финансовое ведомство напомнило, что организации, применяющие УСН, не признаются плательщиками НДС, следовательно, не должны выставлять счета-фактуры. Исключение – ввоз товаров на территорию РФ и уплата НДС при осуществлении операций по договору простого товарищества по ст. 174.1 НК РФ (п. 2 ст. 346.11 НК РФ).
Кроме того, счета-фактуры могут выставлять и комиссионеры (агенты), применяющие УСН и реализующие товары (работы, услуги) комитента (принципала) от своего имени (п. 1 ст. 169 НК РФ).
В иных случаях "упрощенцы" оформлять счета-фактуры не должны.
Таким образом, если покупатель получил счет-фактуру от продавца, применяющего УСН, который не является посредником, действующим от своего имени, принять НДС к вычету он не сможет.
Минфин России не в первый раз выступает с подобной позицией. По мнению финансового ведомства, составление счета-фактуры с выделенным НДС организацией, у которой такой обязанности нет, – нарушение статьи 169 НК РФ.
Следовательно, вычет по такому счету-фактуре для покупателя невозможен (см. письма Минфина России от 18.11.2013 № 03-07-11/49526, от 16.05.2011 № 03-07-11/126, от 29.11.2010 № 03-07-11/456).
Однако подобная точка зрения не является единственной.
Так, в судебной практике сложился иной подход к решению этого спорного вопроса. В своих рассуждениях суды опираются на п. 5 ст. 173 НК РФ, согласно которому лицо, применяющее специальный режим или освобожденное от обязанности уплачивать НДС и выставившее счет-фактуру, обязано перечислить полученный НДС в бюджет.
Следовательно, и покупатель, оплативший счет-фактуру такому контрагенту, вправе принять выделенный в нем НДС к вычету в общем порядке (см. постановления Конституционного Суда РФ от 03.06.2014 № 17-П, АС Западно-Сибирского округа от 21.06.2011 № А45-17039/2010, ФАС Московского округа от 25.09.2012 № А40-79771/11-90-347, от 08.02.2011 № КА-А40/17458-10).
В конечном итоге с такой позицией согласилась и ФНС России (письма ФНС России от 16.02.2015 № ГД-4-3/2366@, от 18.12.2014 № ГД-4-3/26274).